自2013年8月1日起，"营改增"试点扩围至全国的交通运输业和部分现代服务业。新疆天顺本质上属于"现代物流业"，但"营改增"政策并未就第三方物流业务缴纳增值税的税率进行明确规定，税务部门目前将新疆天顺的第三方物流业务纳入"交通运输业"中的陆路货运业务，适用增值税率为11%。
　　由于新疆天顺承运业务大部分由外协供应商完成，在生产经营过程中可抵扣项目较少，"营改增"政策实施后，实际税负有较大程度增加，对公司的赢利能力产生不利影响。新疆天顺预计，2014年"营改增"使税负增加555.09万元，而2013年新疆天顺归属于母公司股东的净利润只有3170.64万元，也就是税负增加了大约净利润的15%。
　　已有多位物流业内人士表示，对于目前"营改增"后大部分成本构成中的主要项目都不能进行抵扣，是税负不降反升的重要原因。相比下一些小公司营业额不大，很多是现金交易，基本不用给客户开增值税发票。虽然一些地方政府针对企业税负过重有不同的补贴返还政策，但具体也要看能抵扣的资产有多少，而且依靠补贴这种方式既很难维持长久，也有违市场化改革的规则。
　　相对于新疆天顺，5A级物流企业黑龙江农垦北大荒物流集团有限公司的副总经理张衡也是苦不堪言。作为省内物流巨头，北大荒物流集团一年的物流业务营业额近2亿元。但目前物流业务利润惨淡，只能靠其他贸易业务来补贴支撑。他忧心忡忡地说，如果照这样亏下去，很多大型物流企业将很快倒闭，"估计挺不过两年"。
　　面对困境，提价似乎是眼下的一个不二选择，但并不是所有企业都有足够的信心能保证在提价后客户的忠诚度。而且，物流行业是一个充分竞争行业，对更多企业来说，提价导致客户流失无异于自杀。
　　大环境下减税问题凸显
　　关于物流企业的税负问题，也是中国大环境下企业发展困境的一个缩影。复旦大学经济学院教授、博士生导师韦森的观点更加明确。他认为，单纯依靠‘营改增无法彻底解决物流企业税负过重问题，关键在于彻底减税。
　　韦森表示，经过多年的经济高速增长，中国经济潜在增速下移已现端倪。中国经济大致潜在增长率目前在5%~7%之间，下行是一个趋势。不止物流业，中国的企业现在非常难。
　　韦森分析道，在目前中国宏观经济下行的情况下，欲保持较高的经济增长速度，不能再靠大规模政府推动的基建投资，而最好和最适宜的宏观政策是减税，不是结构减税，而是总量减税！
　　因此韦森建议，应该把减税写入政府工作报告，把减税变成整个社会的共识，变成自上而下所有政府的施政主要目标。只有在这个共识切实付诸行动后，物流企业的税负问题才可得到更好的解决。
　　应实行人性化税率
　　其实，交通运输业在"营改增"初期，货运企业就普遍出现了税负上升的情况。
　　最早实行"营改增"试点的上海，交通运输业经历了从税负整体增加到整体减少的情况。2012年首季，交通运输业整体增加税收1.2亿元，到2013年四季度，转变为整体减税1.7亿元，并逐步趋于平稳。
　　在全国政协委员吉林大学机械科学与工程学院博士生导师徐涛看来，"增值税最重要的特点就是环环征税，道道抵扣，形成一条看不见的链条。但‘营改增对于现阶段的物流企业来说，达不到‘应抵尽抵的效果。因为与其有业务往来的上游企业中，还有一大部分不是一般纳税人，无法取得增值税专用发票，不能抵扣进项税额，这部分成本费用占比就达到30%。"
　　为此，徐涛建议，国税部门应将税务监管与服务相结合，探索新举措进一步为物流企业减负。一方面严打虚开骗领增值税发票行为，一方面指导企业加强财务管理和税务筹划，帮助企业防控涉税风险。
　　"应该根据各地不同情况实行人性化税率，即物流企业不能取得小规模企业抵扣增值税发票时，上游企业要提供真实可靠的非一般纳税人的证明。同时，税务部门制定相应的增收标准及利率，实施合理的抵扣政策，从而为交通物流行业营造一个良好的市场大环境。"